中国肠道大会是由南京医科大学第二附属医院张发明教授、热心肠生物技术研究院蓝灿辉院长在4届“中国整合肠病学学术会议”基础上，共同发起并于2018年创立的跨学科、跨专业的大型学术交流平台。

非实体、公益属性、由自然人组成的发起人委员会是大会的所有者和最高决策机构。张发明、蓝灿辉是大会创始发起人，魏泓、赵方庆、王军、周宏伟、于君是大会的联合发起人。

由全体发起人讨论一致并签字确认的《中国肠道大会章程》是大会的纲领性文件。章程约定大会由中国肠道领域权威的科研机构和团体联合主办和协办，热心肠研究院是大会的永久独家运营和承办单位。

2018中国肠道大会以“整合赢未来 健康在肠道”为主题，于2018年5月11-13日在北京国家会议中心举行。2019中国肠道大会于5月4-6日在北京亦创国际会展中心举行，确立了“爱肠道、爱学习、爱整合”这一永久主题，并宣布未来大会以两年一届的频率举行。

2021中国肠道大会将在玄武湖畔的南京国际展览中心举行，第三届中国肠道产业大会也将同期同场馆举办。大会预计将吸引4000-5000人参会，继续成为中国乃至世界最大的以肠道为主题的学术盛会。